Johannes Söding

Cytowane przez

	Wszystkie	Od 2019
Cytowania	47109	28503
h-indeks	71	48
i10-indeks	103	91

6000

3000

1500

4500

2006200720082009201020112012201320142015201620172018201920202021202220232024184 218 308 379 518 785 1019 1393 1926 2084 2659 3041 3176 3541 3897 4799 5126 5321 5792

Dostęp publiczny

Wyświetl wszystko

73 artykuły

0 artykułów

dostępne

niedostępne

Objęte finansowaniem

Współautorzy

Andrei LupasDirector of the Department of Protein Evolution, Max-Planck-Institute for BiologyZweryfikowany adres z tuebingen.mpg.de
Martin SteineggerAssociate Professor, Seoul National University, KoreaZweryfikowany adres z snu.ac.kr
Milot MirditaSeoul National UniversityZweryfikowany adres z snu.ac.kr
Andreas BiegertPhD Bioinformatics, Gene Center, LMU MunichZweryfikowany adres z genzentrum.lmu.de
Vikram AlvaMax Planck Institute for BiologyZweryfikowany adres z tuebingen.mpg.de
Patrick CramerDirector, Max Planck Institute for Biophysical ChemistryZweryfikowany adres z mpibpc.mpg.de
Rudolf GrimmProfessor of Physics, University of InnsbruckZweryfikowany adres z uibk.ac.at
des higginsUniversity College DublinZweryfikowany adres z ucd.ie
Holger HartmannGene Center MunichZweryfikowany adres z genzentrum.lmu.de
Eli Levy KarinELKMOZweryfikowany adres z post.tau.ac.il
Clovis GaliezGrenoble-Alpes University, Grenoble INP, LJKZweryfikowany adres z grenoble-inp.fr
Jean DalibardCollège de France and Laboratoire Kastler BrosselZweryfikowany adres z college-de-france.fr
Salma Sohrabi-JahromiMax Planck Institute for Biophysical ChemistryZweryfikowany adres z mpibpc.mpg.de
Stefan SeemayerComputational Biologist at BASF SEZweryfikowany adres z seemayer.de
Roland BeckmannProfessor for Biochemistry, LMU MunichZweryfikowany adres z lmb.uni-muenchen.de
Maria J. MartinEuropean Bioinformatics InstituteZweryfikowany adres z ebi.ac.uk
Jessica AndreaniCEA research director at I2BC (France)Zweryfikowany adres z cea.fr

Obserwuj

Johannes Söding

Max-Planck-Institute for Multidisciplinary Sciences, Göttingen

Zweryfikowany adres z mpinat.mpg.de - Strona główna

Quantitative and computational biology bioinformatics


Tytuł Sortuj wg cytatów Sortuj wg roku Sortuj wg tytułu	Cytowane przez Cytowane przez	Rok
Fast, scalable generation of high‐quality protein multiple sequence alignments using Clustal Omega F Sievers, A Wilm, D Dineen, TJ Gibson, K Karplus, W Li, R Lopez, ... Molecular systems biology 7 (1), 539, 2011	16341	2011
The HHpred interactive server for protein homology detection and structure prediction J Söding, A Biegert, AN Lupas Nucleic acids research 33 (suppl_2), W244-W248, 2005	4047	2005
Protein homology detection by HMM–HMM comparison J Söding Bioinformatics 21 (7), 951-960, 2005	2959	2005
MMseqs2 enables sensitive protein sequence searching for the analysis of massive data sets M Steinegger, J Söding Nature biotechnology 35 (11), 1026-1028, 2017	2653	2017
HHblits: lightning-fast iterative protein sequence searching by HMM-HMM alignment M Remmert, A Biegert, A Hauser, J Söding Nature methods 9 (2), 173-175, 2012	2400	2012
A completely reimplemented MPI bioinformatics toolkit with a new HHpred server at its core L Zimmermann, A Stephens, SZ Nam, D Rau, J Kübler, M Lozajic, ... Journal of molecular biology 430 (15), 2237-2243, 2018	2299	2018
HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation M Steinegger, M Meier, M Mirdita, H Vöhringer, SJ Haunsberger, J Söding BMC bioinformatics 20, 1-15, 2019	949	2019
Fast and accurate protein structure search with Foldseek M van Kempen, SS Kim, C Tumescheit, M Mirdita, J Lee, CLM Gilchrist, ... Nature Biotechnology, 1-4, 2023	796	2023
Clustering huge protein sequence sets in linear time M Steinegger, J Söding Nature communications 9 (1), 2542, 2018	740	2018
Uniclust databases of clustered and deeply annotated protein sequences and alignments M Mirdita, L Von Den Driesch, C Galiez, MJ Martin, J Söding, ... Nucleic acids research 45 (D1), D170-D176, 2017	648	2017
Protein sequence analysis using the MPI bioinformatics toolkit F Gabler, SZ Nam, S Till, M Mirdita, M Steinegger, J Söding, AN Lupas, ... Current Protocols in Bioinformatics 72 (1), e108, 2020	611	2020
Uniform transitions of the general RNA polymerase II transcription complex A Mayer, M Lidschreiber, M Siebert, K Leike, J Söding, P Cramer Nature structural & molecular biology 17 (10), 1272-1278, 2010	569	2010
Fast and accurate automatic structure prediction with HHpred A Hildebrand, M Remmert, A Biegert, J Söding Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 77 (S9), 128-132, 2009	539	2009
CCMpred—fast and precise prediction of protein residue–residue contacts from correlated mutations S Seemayer, M Gruber, J Söding Bioinformatics 30 (21), 3128-3130, 2014	473	2014
MMseqs2 desktop and local web server app for fast, interactive sequence searches M Mirdita, M Steinegger, J Söding Bioinformatics 35 (16), 2856-2858, 2019	425	2019
The MPI bioinformatics Toolkit as an integrative platform for advanced protein sequence and structure analysis V Alva, SZ Nam, J Söding, AN Lupas Nucleic acids research 44 (W1), W410-W415, 2016	415	2016
Protein-level assembly increases protein sequence recovery from metagenomic samples manyfold M Steinegger, M Mirdita, J Söding Nature methods 16 (7), 603-606, 2019	382	2019
Three-body decay of a rubidium Bose–Einstein condensate J Söding, D Guéry-Odelin, P Desbiolles, F Chevy, H Inamori, J Dalibard Applied physics B 69, 257-261, 1999	356	1999
The MPI Bioinformatics Toolkit for protein sequence analysis A Biegert, C Mayer, M Remmert, J Söding, AN Lupas Nucleic acids research 34 (suppl_2), W335-W339, 2006	326	2006
More than the sum of their parts: on the evolution of proteins from peptides J Söding, AN Lupas Bioessays 25 (9), 837-846, 2003	303	2003

Nie można teraz wykonać tej operacji. Spróbuj ponownie później.

Prace 1–20

Cytowania rocznie

Powielone cytowania

Scalone cytowania

Dodaj współautorówWspółautorzy

Obserwuj

Cytowane przez

Współautorzy