Steven Salzberg

Cytowane przez

	Wszystkie	Od 2018
Cytowania	311798	155097
h-indeks	158	109
i10-indeks	327	253

33000

16500

8250

24750

2000200120022003200420052006200720082009201020112012201320142015201620172018201920202021202220231245 3167 4348 5031 5534 5445 5637 5889 5770 6062 6490 7904 9619 11259 13733 15984 18363 20896 22757 26038 28132 31806 32465 13853

Dostęp publiczny

Wyświetl wszystko

177 artykułów

0 artykułów

dostępne

niedostępne

Objęte finansowaniem

Współautorzy

Mihaela PerteaAssociate Professor, Johns Hopkins UniversityZweryfikowany adres z jhu.edu
Ben LangmeadAssociate Professor of Computer Science, Johns Hopkins UniversityZweryfikowany adres z cs.jhu.edu
Cole TrapnellAssistant Professor, University of WashingtonZweryfikowany adres z uw.edu
Daehwan KimMichael L. Rosenberg Assistant Professor of Bioinformatics at the University of Texas SouthwesternZweryfikowany adres z UTSouthwestern.edu
Simon KasifProfessor of Biomedical Engineering, Computer Science and Bioinformatics, Boston UniversityZweryfikowany adres z bu.edu
Mihai PopProfessor of Computer Science, University of Maryland, College ParkZweryfikowany adres z umd.edu
Daniela PuiuJohns Hopkins UniversityZweryfikowany adres z jhu.edu
Aleksey V ZiminAssociate Research Scientist, Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins UnviersityZweryfikowany adres z jhu.edu
Owen WhiteDirector of Bioinformatics, Institute for Genome Sciences, Professor, Department of Epidemiology and Preventative, University ofZweryfikowany adres z som.umaryland.edu
Lior PachterBren Professor of Computational Biology, CaltechZweryfikowany adres z caltech.edu
Adam M. PhillippySr. Investigator, National Human Genome Research Institute, NIHZweryfikowany adres z nih.gov
Michael C. SchatzBloomberg Distinguished Professor, Johns Hopkins UniversityZweryfikowany adres z cs.jhu.edu
Florian P BreitwieserSenior Software Engineer at SOPHiA GeneticsZweryfikowany adres z jhu.edu
David R KelleyCalico LabsZweryfikowany adres z calicolabs.com
James YorkeDist. Univ. Research Prof of Math and Physics, Univ. of MarylandZweryfikowany adres z umd.edu
David NealeUniversity California, Davis USDAZweryfikowany adres z ucdavis.edu
Guillaume MarcaisProject ScientistZweryfikowany adres z cs.cmu.edu
Martin ShumwayStaff Scientist, National Library of MedicineZweryfikowany adres z ncbi.nlm.nih.gov
Charles H. LangleyProfessor, University of California - DavisZweryfikowany adres z ucdavis.edu
Jonathan A. EisenProfessor, University of California, Davis (UC Davis), Department of Evolution and EcologyZweryfikowany adres z ucdavis.edu

Obserwuj

Steven Salzberg

Bloomberg Distinguished Professor, Johns Hopkins University

Zweryfikowany adres z jhu.edu - Strona główna

Computational Biology Genomics Genome assembly Bioinformatics Metagenomics


Tytuł Sortuj wg cytatów Sortuj wg roku Sortuj wg tytułu	Cytowane przez Cytowane przez	Rok
Fast gapped-read alignment with Bowtie 2 B Langmead, SL Salzberg Nature methods 9 (4), 357-359, 2012	39631	2012
Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome B Langmead, C Trapnell, M Pop, SL Salzberg Genome biology 10 (3), 1-10, 2009	21991	2009
The sequence of the human genome JC Venter, MD Adams, EW Myers, PW Li, RJ Mural, et al. Science 291 (5507), 1304-1351, 2001	19719	2001
Transcript assembly and quantification by RNA-Seq reveals unannotated transcripts and isoform switching during cell differentiation C Trapnell, BA Williams, G Pertea, A Mortazavi, G Kwan, MJ Van Baren, ... Nature biotechnology 28 (5), 511-515, 2010	14385	2010
HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements D Kim, B Langmead, SL Salzberg Nature methods 12 (4), 357-360, 2015	13395	2015
TopHat: discovering splice junctions with RNA-Seq C Trapnell, L Pachter, SL Salzberg Bioinformatics 25 (9), 1105-1111, 2009	12795	2009
TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions D Kim, G Pertea, C Trapnell, H Pimentel, R Kelley, SL Salzberg Genome biology 14 (4), 1-13, 2013	12435	2013
Differential gene and transcript expression analysis of RNA-seq experiments with TopHat and Cufflinks C Trapnell, A Roberts, L Goff, G Pertea, D Kim, DR Kelley, H Pimentel, ... Nature protocols 7 (3), 562-578, 2012	12030	2012
Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana. GI Arabidopsis Nature 408 (6814), 796, 2000	10800	2000
FLASH: fast length adjustment of short reads to improve genome assemblies T Magoč, SL Salzberg Bioinformatics 27 (21), 2957-2963, 2011	10410	2011
StringTie enables improved reconstruction of a transcriptome from RNA-seq reads M Pertea, GM Pertea, CM Antonescu, TC Chang, JT Mendell, SL Salzberg Nature biotechnology 33 (3), 290-295, 2015	6601	2015
Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum MJ Gardner, N Hall, E Fung, O White, M Berriman, RW Hyman, JM Carlton, ... Nature 419 (6906), 498-511, 2002	5233	2002
Versatile and open software for comparing large genomes S Kurtz, A Phillippy, AL Delcher, M Smoot, M Shumway, C Antonescu, ... Genome biology 5 (2), R12, 2004	5133	2004
Graph-based genome alignment and genotyping with HISAT2 and HISAT-genotype D Kim, JM Paggi, C Park, C Bennett, SL Salzberg Nature biotechnology 37 (8), 907-915, 2019	4589	2019
Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie and Ballgown M Pertea, D Kim, GM Pertea, JT Leek, SL Salzberg Nature protocols 11 (9), 1650-1667, 2016	3902	2016
The transcriptional landscape of the mammalian genome P Carninci, T Kasukawa, S Katayama, J Gough, MC Frith, N Maeda, ... science 309 (5740), 1559-1563, 2005	3898	2005
Kraken: ultrafast metagenomic sequence classification using exact alignments DE Wood, SL Salzberg Genome biology 15 (3), 1-12, 2014	3628	2014
Identifying bacterial genes and endosymbiont DNA with Glimmer AL Delcher, KA Bratke, EC Powers, SL Salzberg Bioinformatics 23 (6), 673-679, 2007	2911	2007
Improved microbial gene identification with GLIMMER AL Delcher, D Harmon, S Kasif, O White, SL Salzberg Nucleic acids research 27 (23), 4636-4641, 1999	2858	1999
Genomic sequence of a Lyme disease spirochaete, Borrelia burgdorferi CM Fraser, S Casjens, WM Huang, GG Sutton, R Clayton, R Lathigra, ... Nature 390 (6660), 580-586, 1997	2560	1997

Nie można teraz wykonać tej operacji. Spróbuj ponownie później.

Prace 1–20

Cytowania rocznie

Powielone cytowania

Scalone cytowania

Dodaj współautorówWspółautorzy

Obserwuj

Cytowane przez

Współautorzy