Jakub Rydzewski - Cytowania w Google Scholar

Cytowane przez

	Wszystkie	Od 2015
Cytowania	174	172
h-indeks	7	7
i10-indeks	5	5

201620172018201920207 21 30 53 61

Współautorzy

Wieslaw NowakProfessor of Physics, Institute of Physics, Nicolaus Copernicus University, Torun, PolandZweryfikowany adres z fizyka.umk.pl
Rafał JakubowskiUniversity of WarsawZweryfikowany adres z fizyka.umk.pl
Helmut GrubmullerTheoretical and Computational Biophysics Department, Max Planck Institute for Biophysical ChemistryZweryfikowany adres z gwdg.de
Omar ValssonMax Planck Institute for Polymer ResearchZweryfikowany adres z mpip-mainz.mpg.de
Wojciech StrzalkaJagiellonian UniversityZweryfikowany adres z uj.edu.pl
Jacek BlazewiczProfesor informatyki, Politechnika PoznanskaZweryfikowany adres z cs.put.poznan.pl
Giovanni BussiScuola Internazionale Superiore di Studi Avanzati, Trieste, ItalyZweryfikowany adres z sissa.it
Massimiliano BonomiInstitut Pasteur - CNRSZweryfikowany adres z pasteur.fr
Gareth TribelloSchool of Maths and Physics, Queen's University BelfastZweryfikowany adres z qub.ac.uk
Michele VendruscoloProfessor of Biophysics, University of CambridgeZweryfikowany adres z cam.ac.uk
David QuigleyProfessor, University of WarwickZweryfikowany adres z warwick.ac.uk
Bernd EnsingAssociate Professor of Computational Chemistry, University of AmsterdamZweryfikowany adres z uva.nl
Paolo CarloniForschungszentrum JülichZweryfikowany adres z fz-juelich.de
Pratyush TiwaryAssistant Professor, University of Maryland, College ParkZweryfikowany adres z umd.edu
Peter Bolhuisvan 't Hoff institute for Molecular Sciences, University of AmsterdamZweryfikowany adres z uva.nl
Alessandro LaioSISSAZweryfikowany adres z sissa.it
michele parrinelloDepartment of ChemistryZweryfikowany adres z phys.chem.ethz.ch
Kresten Lindorff-LarsenLinderstrøm-Lang Centre for Protein Science, Department of Biology, University of CopenhagenZweryfikowany adres z bio.ku.dk
Davide BranduardiComputational Chemistry & Informatics Group at AstexZweryfikowany adres z astx.com
Michele CeriottiAssistant Professor at EPFL, Institute of MaterialsZweryfikowany adres z epfl.ch

Jakub Rydzewski

Institute of Physics, Nicolaus Copernicus University

Zweryfikowany adres z fizyka.umk.pl - Strona główna

Atomistic Simulations Enhanced Sampling Methods Molecular Dynamics Machine Learning


Tytuł Sortuj wg cytatów Sortuj wg roku Sortuj wg tytułu	Cytowane przez Cytowane przez	Rok
Promoting transparency and reproducibility in enhanced molecular simulations M Bonomi, G Bussi, C Camilloni, GA Tribello, P Banáš, A Barducci, ... Nature methods 16 (8), 670-673, 2019	49	2019
Ligand diffusion in proteins via enhanced sampling in molecular dynamics J Rydzewski, W Nowak Physics of Life Reviews 22, 58-74, 2017	36	2017
Memetic algorithms for ligand expulsion from protein cavities J Rydzewski, W Nowak The Journal of chemical physics 143 (12), 124101, 2015	21	2015
Machine learning based dimensionality reduction facilitates ligand diffusion paths assessment: a case of cytochrome P450cam J Rydzewski, W Nowak Journal of Chemical Theory and Computation 12, 2110 − 2120, 2016	19	2016
Kinetics of huperzine A dissociation from acetylcholinesterase via multiple unbinding pathways J Rydzewski, R Jakubowski, W Nowak, H Grubmüller Journal of chemical theory and computation 14 (6), 2843-2851, 2018	11	2018
Thermodynamics of camphor migration in cytochrome P450cam by atomistic simulations J Rydzewski, W Nowak Scientific Reports 7, 7736, 2017	9	2017
Communication: Entropic measure to prevent energy over-minimization in molecular dynamics simulations J Rydzewski, R Jakubowski, W Nowak The Journal of chemical physics 143 (17), 171103, 2015	8	2015
Rare-event sampling in ligand diffusion: Reply to comments on" Ligand diffusion in proteins via enhanced sampling in molecular dynamics" J Rydzewski, W Nowak Physics of Life Reviews 22, 85-87, 2017	6	2017
Finding multiple reaction pathways of ligand unbinding J Rydzewski, O Valsson The Journal of chemical physics 150 (22), 221101, 2019	4	2019
Photoinduced transport in an H64Q neuroglobin antidote for carbon monoxide poisoning J Rydzewski, W Nowak The Journal of Chemical Physics 148 (11), 115101, 2018	3	2018
maze: Heterogeneous ligand unbinding along transient protein tunnels J Rydzewski Computer Physics Communications 247, 106865, 2020	2	2020
Conformational sampling of a biomolecular rugged energy landscape J Rydzewski, R Jakubowski, G Nicosia, W Nowak IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 15 (3 …, 2016	2	2016
Nanomechanics of PCNA: a protein-made DNA sliding clamp J Rydzewski, W Strzalka, W Nowak Chemical Physics Letters 634, 236–242, 2015	2	2015
Prebiotic Soup Components Trapped in Montmorillonite Nanoclay Form New Molecules: Car-Parrinello Ab Initio Simulations JF Carrascoza Mayén, J Rydzewski, N Szostak, J Blazewicz, W Nowak Life 9 (2), 46, 2019	1	2019
Molecular dynamics simulations of large systems in electronic excited states J Rydzewski, W Nowak Handbook of Computational Chemistry, 2016	1	2016
Non-Equilibrium Processes in Proteins Triggered by Light: Excited States Molecular Dynamics Perspective J Rydzewski, L Peplowski, K Walczewska-Szewc, P Miszta, ... European Biophysics Journal with Biophysics Letters 48, S44-S44, 2019		2019
Rare-Event Sampling of Ligand Transport in Proteins J Rydzewski Institute of Physics, Nicolaus Copernicus University, 2018		2018
Photoswitchable Drugs and Insulin Release: Molecular Events in the EPAC2A Protein L Peplowski, J Rydzewski, T Miyahara, H Nakamura, H Nakatsuji, ... Biophysical Journal 114 (3), 31a, 2018		2018
Inferring pathological states in cortical neuron microcircuits J Rydzewski, W Nowak, G Nicosia Journal of theoretical biology 386, 34-43, 2015		2015
On the role of metal ions in synaptic proteins assembly R Jakubowski, J Rydzewski, W Nowak Protein science 24, 161-162, 2015		2015

Nie można teraz wykonać tej operacji. Spróbuj ponownie później.

Prace 1–20

Cytowania rocznie

Powielone cytowania

Scalone cytowania

Dodaj współautorówWspółautorzy

Prześlij plik w formacie PDF

Obserwuj tego autora

Cytowane przez

Współautorzy