Denis Schapiro

Cytowane przez

	Wszystkie	Od 2020
Cytowania	7207	6360
h-indeks	25	25
i10-indeks	27	27

1800

900

450

1350

20142015201620172018201920202021202220232024202521 70 97 128 192 292 506 1019 1330 1527 1761 203

Dostęp publiczny

Wyświetl wszystko

36 artykułów

0 artykułów

dostępne

niedostępne

Objęte finansowaniem

Współautorzy

Bernd BodenmillerDual Professor University of Zurich and ETH Zurich. Director, Department of Quantitative BiomedicineZweryfikowany adres z uzh.ch
Peter J. SchüfflerTUMZweryfikowany adres z tum.de
Joachim M. BuhmannETH ZurichZweryfikowany adres z inf.ethz.ch
Vito RT ZanotelliUniversity Children's Hospital Zurich/University of ZurichZweryfikowany adres z kispi.uzh.ch
Peter K. SorgerHarvard Medical SchoolZweryfikowany adres z hms.harvard.edu
Sanja VickovicNYGC, Columbia University, Uppsala UniversityZweryfikowany adres z nygenome.org
Hartland Warren JacksonInvestigator, Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Mount Sinai HospitalZweryfikowany adres z lunenfeld.ca
Patrik StåhlKTH, Royal Institute of TechnologyZweryfikowany adres z kth.se
Julio Saez RodriguezHeidelberg UniversityZweryfikowany adres z uni-heidelberg.de
Jana R FischerPhD student, University of ZurichZweryfikowany adres z uzh.ch
Joakim LundebergSciLifeLab, KTH Royal Institute of TechnologyZweryfikowany adres z scilifelab.se
Jeremy L MuhlichDirector of Software Engineering, Harvard Medical School Laboratory of Systems PharmacologyZweryfikowany adres z hms.harvard.edu
Johanna KlughammerBroad Institute of MIT and HarvardZweryfikowany adres z broadinstitute.org
Gokcen EraslanPrincipal Scientist @ GenentechZweryfikowany adres z gene.com
Joshua GouldBroad InstituteZweryfikowany adres z broadinstitute.org
Fredrik SalménKTH Royal Institute of TechnologyZweryfikowany adres z scilifelab.se
Xiaokang LunWyss Institute, Harvard UniversityZweryfikowany adres z wyss.harvard.edu
Oliver StegleGerman Cancer Research Center (DKFZ) & EMBL HeidelbergZweryfikowany adres z dkfz.de
Fanny Pelissier VatterWeill CornellZweryfikowany adres z med.cornell.edu

Obserwuj

Denis Schapiro

Group Leader at the Heidelberg University Hospital

Zweryfikowany adres z bioquant.uni-heidelberg.de - Strona główna

Spatial Omics Spatial Biology Multiplexed Imaging


Tytuł Sortuj wg cytatów Sortuj wg roku Sortuj wg tytułu	Cytowane przez Cytowane przez	Rok
Highly multiplexed imaging of tumor tissues with subcellular resolution by mass cytometry C Giesen, HAO Wang, D Schapiro, N Zivanovic, A Jacobs, B Hattendorf, ... Nature methods 11 (4), 417-422 -- *Authors contributed equally, 2014	1807	2014
High-definition spatial transcriptomics for in situ tissue profiling S Vickovic, G Eraslan, F Salmén, J Klughammer, L Stenbeck, ... Nature methods 16 (10), 987-990 -- Authors contributed equally, 2019	1010	2019
A molecular single-cell lung atlas of lethal COVID-19 JC Melms, J Biermann, H Huang, Y Wang, A Nair, S Tagore, I Katsyv, ... Nature 595 (7865), 114-119, 2021	596	2021
histoCAT: analysis of cell phenotypes and interactions in multiplex image cytometry data D Schapiro, HW Jackson, S Raghuraman, JR Fischer, VRT Zanotelli, ... Nature methods 14 (9), 873-876, 2017	596	2017
The human tumor atlas network: charting tumor transitions across space and time at single-cell resolution O Rozenblatt-Rosen, A Regev, P Oberdoerffer, T Nawy, A Hupalowska, ... Cell 181 (2), 236-249, 2020	458	2020
Spatial multi-omic map of human myocardial infarction C Kuppe, RO Ramirez Flores, Z Li, S Hayat, RT Levinson, X Liao, ... Nature 608 (7924), 766-777, 2022	377	2022
Simultaneous multiplexed imaging of mRNA and proteins with subcellular resolution in breast cancer tissue samples by mass cytometry D Schulz, VRT Zanotelli, JR Fischer, D Schapiro, S Engler, XK Lun, ... Cell systems 6 (1), 25-36. e5, 2018	293	2018
Single-nucleus and spatial transcriptome profiling of pancreatic cancer identifies multicellular dynamics associated with neoadjuvant treatment WL Hwang, KA Jagadeesh, JA Guo, HI Hoffman, P Yadollahpour, ... Nature genetics 54 (8), 1178-1191, 2022	258*	2022
A map of human type 1 diabetes progression by imaging mass cytometry N Damond, S Engler, VRT Zanotelli, D Schapiro, CH Wasserfall, ... Cell metabolism 29 (3), 755-768. e5, 2019	254	2019
Immunogenomic profiling determines responses to combined PARP and PD-1 inhibition in ovarian cancer A Färkkilä, DC Gulhan, J Casado, CA Jacobson, H Nguyen, ... Nature communications 11 (1), 1459, 2020	244	2020
Modeling cell-cell interactions from spatial molecular data with spatial variance component analysis D Arnol, D Schapiro, B Bodenmiller, J Saez-Rodriguez, O Stegle Cell reports 29 (1), 202-211. e6, 2019	179	2019
MCMICRO: a scalable, modular image-processing pipeline for multiplexed tissue imaging D Schapiro, A Sokolov, C Yapp, YA Chen, JL Muhlich, J Hess, ... Nature methods 19 (3), 311-315, 2022	170	2022
Explainable multiview framework for dissecting spatial relationships from highly multiplexed data J Tanevski, ROR Flores, A Gabor, D Schapiro, J Saez-Rodriguez Genome biology 23 (1), 97, 2022	130	2022
Dissecting the treatment-naive ecosystem of human melanoma brain metastasis J Biermann, JC Melms, AD Amin, Y Wang, LA Caprio, A Karz, S Tagore, ... Cell 185 (14), 2591-2608. e30, 2022	116	2022
Receptor-driven ERK pulses reconfigure MAPK signaling and enable persistence of drug-adapted BRAF-mutant melanoma cells L Gerosa, C Chidley, F Fröhlich, G Sanchez, SK Lim, J Muhlich, JY Chen, ... Cell systems 11 (5), 478-494. e9, 2020	109	2020
Evolution of delayed resistance to immunotherapy in a melanoma responder D Liu, JR Lin, EJ Robitschek, GG Kasumova, A Heyde, A Shi, A Kraya, ... Nature medicine 27 (6), 985-992, 2021	93	2021
Automatic single cell segmentation on highly multiplexed tissue images PJ Schüffler, D Schapiro, C Giesen, HAO Wang, B Bodenmiller, ... Cytometry Part A 87 (10), 936-942 -- *Authors contributed equally, 2015	63	2015
High-dimensional phenotyping identifies age-emergent cells in human mammary epithelia FAP Vatter, D Schapiro, H Chang, AD Borowsky, JK Lee, B Parvin, ... Cell reports 23 (4), 1205-1219, 2018	61	2018
MITI minimum information guidelines for highly multiplexed tissue images D Schapiro, C Yapp, A Sokolov, SM Reynolds, YA Chen, D Sudar, Y Xie, ... Nature methods 19 (3), 262-267, 2022	56	2022
Highly multiplexed immunofluorescence images and single-cell data of immune markers in tonsil and lung cancer R Rashid, G Gaglia, YA Chen, JR Lin, Z Du, Z Maliga, D Schapiro, C Yapp, ... Scientific data 6 (1), 323, 2019	54	2019

Nie można teraz wykonać tej operacji. Spróbuj ponownie później.

Prace 1–20

Cytowania rocznie

Powielone cytowania

Scalone cytowania

Dodaj współautorówWspółautorzy

Obserwuj

Cytowane przez

Współautorzy